El CATNIX cuenta con dos servidores de tiempo NTP (Network Time Protocol) de Meinberg. El NTP se utiliza para la sincronización horaria de dispositivos.

Los servidores NTP del CATNIX se encuentran en dos de las ubicaciones del punto neutro. Ambos utilizan salidas a internet diferenciadas y en caso de fallo en uno de los enlaces o los servidores, se utiliza el otro.

Se trata de dispositivos de cronometraje de alta precisión. Siguiendo el sistema jerárquico y semicapa de fuentes de tiempo utilizado por los NTP, los dos Meinberg del CATNIX actúan como Stratum 0/1, donde 0 es el reloj de referencia, y se sincronizan con los satélites con los que tienen visibilidad en cada momento (entre 3 y 8).

Las entidades conectadas en el CATNIX pueden sincronizar sus servidores NTP (Stratum 2), desde los que sincronizan todos sus dispositivos.